Mortal Kombat beginnt mit einer epischen Eröffnungssequenzen zwischen den Klans von Hanzo und Bi-Han (Warrior’s Joe Taslim). Aber weder Hanzo noch Bi-Han sind Hauptcharaktere des Films. Diese Rolle kommt Lewis Tan zu, der Cole Young, einen „abgewrackten MMA-Kämpfer“ mit auffälligem Muttermal am Bauch – dem Mortal Kombat-Symbol – spielt, den wir in der Gegenwart kennenlernen. Cole hat keine Ahnung davon, wo er herkommt oder wer seine Vorfahren sind.

Er weiß nur, dass sein Muttermal zum entscheidenden Schlüssel im Kampf um die Zukunft der Menschheit werden könnte – und offenbar nicht nur er. Denn der böse Zauberer Shang Tsung (Skyscraper’s Chin Han) hat ebenfalls Wind von dem Neuzugang bekommen und setzt Sub-Zero (Joe Taslim aus The Raid), jetzt ausgestattet mit Frostmagie, auf ihn an.